MDO5
INITIATION A BASH ET R

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Objectifs pédagogiques de la formation :

Connaitre les bases de bash et de R, 2 programmes très utilisés en bioinformatique et en biostatistiques.

Public concerné :

Connaitre les bases de bash et de R, 2 programmes très utilisés en bioinformatique et en biostatistiques.

Durée et lieu :

Durée : 7 heures sur 1 jour.
Lieu : En Inter au centre de formation Soladis de Paris ou Lyon (pour consulter le calendrier, cliquez sur “S’inscrire”) ou en Intra sur votre site (minimum de 4 personnes)

Tarifs :

Inter : 700€ HT par stagiaire
Intra : Nous consulter pour une offre adaptée à votre entreprise.

Responsable Omics : Agnès ILTIS

“Le volume de données dans les analyses de données biologiques ou non rendent nécessaire l’utilisation de méthode programmatique pour mener à bien de nombreux projets, notamment dans le domaine des omics. Ainsi, l’utilisation des lignes de commandes et de leurs interpréteurs, ou shell, tel que Bash, est nécessaire ne serait-ce que parce qu’une majorité des programmes en bioinformatique ne sont disponibles qu’en lignes de commande. Une fois les résultats obtenus, il est généralement utile de pouvoir les analyser, notamment d’un point de vue statistique, et R convient parfaitement à ce rôle tant par l’existence d’une grande communauté de développeurs et d’utilisateurs, par l’existence de fonctions spécifiques à diverses applications ou par sa capacité à gérer de large volume de données.”

S’inscrire

Soladis vous invite à participer à cette formation d’initiation aux langages Bash et R qui a pour but de vous permettre de commencer à manipuler ces deux langages qui sont parmi les plus utilisés par les bioinformaticiens et biostatisticiens afin de pouvoir commencer à analyser vos données par vous-mêmes. Cette formation s’adresse à tout public n’ayant aucune expérience particulière en programmation ou à ceux qui, connaissant d’autres langages informatiques, voudraient se familiariser avec les bases de bash et/ou R. En particulier, les stagiaires prévoyant de participer aux autres formations « omics » proposés par Soladis ne pourront que tirer avantage de cette formation pour mieux profiter des aspects pratiques des autres modules.

Programme de la formation

Introduction

Langages de programmation : Concepts de base
Qu’est-ce que bash et R

Bash et terminal

Introduction aux concepts de terminal et de lignes de commandes
Principales commandes
Scripting et exercices pratiques

Le langage R

Présentation de l’interface de R et RStudio
Principales commandes
Exercices pratiques

N’hésitez pas à revenir vers nous pour plus d’informations concernant cette formation d’initiation à bash et R pouvant être organisée dans notre centre de formation (dates fournies sur notre site web) ou directement dans vos locaux.