MDO1
INTRODUCTION AUX METHODES DE SEQUENCAGE NGS ET APPLICATIONS EN GENOMIQUE, METAGENOMIQUE ET TRANSCRIPTOMIQUE

Objectifs pédagogiques de la formation :

Comprendre le principe des méthodes de séquençage nouvelle génération et explorer les applications NGS autour des problématiques OMICs

Public concerné :

Tout public (biologistes, biostatisticiens, chargés de projets…)
Bases en biologie nécessaires.

Durée et lieu :

  • Durée : 7 heures sur 1 jour
  • Lieu : En Inter au centre de formation Soladis de Paris ou Lyon (pour consulter le calendrier, cliquez sur « S’inscrire ») ou en Intra sur votre site (minimum de 4 personnes)

Tarifs :

  • Inter : 675€ HT par stagiaire
  • Intra : Nous consulter pour une offre adaptée à votre entreprise.
agnes

Responsable Omics : Agnès ILTIS

« De nombreux projets d’analyse de données OMICs s’appuient aujourd’hui sur les possibilités de production haut-débit apportées par les nouvelles technologies de séquençage. Soladis vous invite à participer à cette formation introductive aux projets de Next Generation Sequencing (NGS) qui a pour objectif de vous donner un aperçu du principe et des applications de ces nouvelles méthodes de séquençage en OMICs. »

Soladis vous invite à participer à cette formation aux méthodes de séquençage NGS et applications en génomique, métagénomique et transcriptomique qui a pour objectif de vous sensibilisés à la thématique « Omic ». Cette formation s’adresse à tout public à orientation biologique souhaitant comprendre et approfondir ses connaissances du sujet afin de lancer et mener à bien des projets d’exploration de données de type NGS.

Programme de la formation

Introduction

  • Historique du séquençage : Du Sanger au Single Cell
  • Evolution des applications en big data

Comprendre les concepts des séquençages NGS

  • Comprendre les différentes méthodes de séquençage
  • Appréhender les caractéristiques d’un séquençage : temps de séquençage, longueur de reads, profondeur, choix des librairies…

Traitement des données de séquençage

  • Comprendre les sorties brutes des séquenceurs
  • Assurer un contrôle qualité des données
  • Analyse des données du génome : assemblage de novo vs mapping
  • Aperçu des principales bases de données

Exemples d’applications des NGS

  • Epidémiologie bactérienne et génomique comparative
  • Analyse différentielle en oncologie et recherche de signatures
  • Métagénomique ciblée en cosmétologie
  • Métagénomique fonctionnelle du microbiote intestinal

Application pratique à des cas types

  • Partage et discussion autour d’exemples d’application

N’hésitez pas à revenir vers nous pour plus d’informations concernant cette formation de sensibilisation aux Omics pouvant être organisée dans notre centre de formation (dates fournies sur notre site web) ou directement dans vos locaux.

institute.soladis-blanc

Soladis
8 rue Bellecombe
69006 LYON - FRANCE

Tél: +33(0)3.28.09.94.70
Fax: +33(0)4.72.83.86.71

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